Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms