Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms