Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms