Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms