Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UPB1Q9UBR1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UPB1Q9UBR1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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UPB1Q9UBR1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UPB1Q9UBR1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPB1Q9UBR1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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