Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms