Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RDH8Q9NYR8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RDH8Q9NYR8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RDH8Q9NYR8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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