Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms