Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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