Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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