Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms