Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms