Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms