Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms