Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms