Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms