Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPG4P5Q96PW8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms