Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms