Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms