Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms