Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms