Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIPA1Q96FS4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIPA1Q96FS4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms