Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT2Q96EX2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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