Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms