Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXPE2Q96DL1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms