Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDAC11Q96DB2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms