Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms