Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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