Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms