Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms