Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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