Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TMIEQ8NEW7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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TMIEQ8NEW7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TMIEQ8NEW7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TMIEQ8NEW7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TMIEQ8NEW7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TMIEQ8NEW7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
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TMIEQ8NEW7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TMIEQ8NEW7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TMIEQ8NEW7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIEQ8NEW7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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