Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms