Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms