Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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USP53Q70EK8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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USP53Q70EK8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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USP53Q70EK8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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USP53Q70EK8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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USP53Q70EK8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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USP53Q70EK8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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USP53Q70EK8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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USP53Q70EK8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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USP53Q70EK8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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USP53Q70EK8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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