Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms