Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms