Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQ80

ANKRD20A2, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A2, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A2Q5SQ80 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD20A2Q5SQ80 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD20A2Q5SQ80 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD20A2Q5SQ80 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms