Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AL512635.1-201ENST00000414056 832 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 RPL12P2-201ENST00000424565 493 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 C5orf67-201ENST00000438651 765 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 LINC00337-202ENST00000441724 1138 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC115619.1-201ENST00000567376 1605 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 UGT3A1-202ENST00000333811 1114 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms