Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms