Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UVSSAQ2YD98 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms