Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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