Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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