Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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