Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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