Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NEDD8Q15843 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NEDD8Q15843 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NEDD8Q15843 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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