Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CST6Q15828 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CST6Q15828 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CST6Q15828 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CST6Q15828 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CST6Q15828 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CST6Q15828 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CST6Q15828 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CST6Q15828 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CST6Q15828 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CST6Q15828 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms