Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms