Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms