Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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